Министерство строительства и жилищно-коммунального хозяйства Республики Алтай является исполнительным органом власти Республики Алтай, осуществляющим функции по выработке государственной политики Республики Алтай, нормативно-правовому регулированию в сфере социально-экономического развития муниципальных образований, осуществления строительства, архитектуры, градостроительства, жилищно-коммунального комплекса, газового хозяйства и энергетики, сейсмобезопасности, ценообразования в области строительства.
В состав министерства входят семь основных отделов, курирующих вопросы экономики, финансов, функционирования жилищно-коммунального хозяйства, строительства, градостроительства и архитектуры, правового обеспечения деятельности министерства. Имеется кадровая, юридическая и хозяйственная службы.
В ведении министерства находятся следующие государственные предприятия, учреждения и организации:
— «Управление капитального строительства Республики Алтай»;
— «Республиканское управление автомобильных дорог общего пользования «Горно-Алтайавтодор»;
— «Государственная экспертиза Республики Алтай»;
— «Региональный фонд капитального ремонта многоквартирных домов на территории Республики Алтай»;
— «Комитет по тарифам Республики Алтай».